История стартует в 21 веке, когда археологическая экспедиция находит в Африке артефакт неизвестной цивилизации, скорее всего инопланетной, погруженный до этого в озеро. Далее, спустя 4 тысячелетия, когда человечество уже давно вышло в космос, люди снова сталкиваются с этими артефактами, названными «Зохар». При соприкосновении с ними люди исчезают. У человечества возникли проблемы: на него напали неизвестные пришельцы из параллельных миров, названные «Гносис». Люди оказались бессильны противостоять им, и тогда исследовательская корпорация разрабатывает для защиты человечества искусственные формы жизни и боевых андроидов, а также экзоскелеты. Во время рейда флота корпорации он оказывается уничтожен гносисами, а немногие выжившие оказываются вовлечены в борьбу с таинственной организацией U-Tic, ставящей целью с помощью пришельцев добиться неограниченной власти и личного могущества и бессмертия для ее членов. Также они желают добиться преобразования человечества, с выходом его на новый, небиологический уровень развития. В ходе событий герои нередко встречаются с разными моментами истории, больше узнают о своем внутреннем мире, а также о целях своих противников. Оказывается, что люди сами «пригласили» гносисов в свой мир благодаря исследованиям пространства и времени и попыткам получить неограниченную власть над природой.